Die Antonius Kirche verfügt über zwei Generationen von Fenstern. Zur ersten Generation zählen die ursprünglichen Fenster, die von Beginn der Kirche an das Bauwerk schmücken. Diese Fenster gefallen durch ihre kunstvoll gestalteten Heiligen-Darstellungen. In jedem dieser Langhausfenster sind jeweils eine weibliche und eine männliche Heiligengestalt zu sehen. Jedoch wurden während des 2. Weltkrieges einige dieser wertvollen Fenster zerstört.
Als Ersatz wurden zeitgenössische, von Schwester Erentrud Trost entworfene, Fenster eingebaut. Diese neuen Fenster sind nicht so kunstvoll gestaltet wie die alte Generation. Sie verleihen dem Kirchraum aber bei entsprechender Sonneneinstrahlung eine mystische Atmosphäre.

